Audit Dalam telah ditubuhkan sebagai satu Bahagian di Pejabat Setiausaha Kewangan Negeri dan ia mula beroperasi pada bulan Januari 1996. Bahagian itu diketuai oleh seorang Pengarah Audit Dalam. Bagi menjamin beliau mempunyai kebebasan dalam menjalankan kerja audit dalaman, beliau melapor terus kepada Setiausaha Kewangan Negeri. Pada bulan Mac 2001, Bahagian itu telah dipindah ke Jabatan Ketua Menteri dan digelar semula sebagai Unit Audit Dalam. Pengarah Audit Dalam kini melapor terus kepada Setiausaha Kerajaan Negeri dan ini jelas mempertingkatkan lagi kebebasan beliau dalam melaksanakan tugas beliau.

Pengarah Audit Dalam diberi kuasa untuk memeriksa segala harta benda, rekod dan fungsi Kementerian, Jabatan, Badan Berkanun Negeri dan Pihak Berkuasa Tempatan. Untuk membolehkan Pengarah Audit Dalam melaksanakan kewajipannya, beliau diberi kuasa untuk mengakses secara bebas dan tanpa halangan segala fungsi, rekod, harta benda dan personel Kementerian, Jabatan, Badan Berkanun Negeri dan Pihak Berkuasa Tempatan, jika perlu, dengan izin daripada Setiausaha Kerajaan Negeri.